Table 2 Primer sequences
From: YAP represses intestinal inflammation through epigenetic silencing of JMJD3
Gene | Species | Forward primer | Reverse primer |
|---|---|---|---|
GAPDH | Homo | 5′GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT 3′ | 5′GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG 3′ |
YAP | Homo | 5′TAGCCCTGCGTAGCCAGTTA 3′ | 5′TCATGCTTAGTCCACTGTCTGT 3′ |
JMJD3 | Homo | 5′CGCTGCCTCACCCATATCC 3′ | 5′ATCCGCGACCTCTGAACTCT 3′ |
EZH2 | Homo | 5′AATCAGAGTACATGCGACTGAGA 3′ | 5′GCTGTATCCTTCGCTGTTTCC 3′ |
IL-1β | Homo | 5′ATGATGGCTTATTACAGTGGCAA3′ | 5′GTCGGAGATTCGTAGCTGGA 3′ |
IL-8 | Homo | 5′ACTGAGAGTGATTGAGAGTGGAC 3′ | 5′AACCCTCTGCACCCAGTTTTC 3′ |
IL-12 | Homo | 5′AGCTTTGCATTCATGGTCTTGA 3′ | 5′ATGGCCCTGTGCCTTAGTAGT 3′ |
IL-18 | Homo | 5′TCTTCATTGACCAAGGAAATCGG 3′ | 5′TCCGGGGTGCATTATCTCTAC 3′ |
CXCL3 | Homo | 5′CGCCCAAACCGAAGTCATAG 3′ | 5′GCTCCCCTTGTTCAGTATCTTTT 3′ |
CXCL2 | Homo | 5′CTGCGCTGCCAGTGCTT3′ | 5′CCTTCACACTTTGGATGTTCTTGA3′ |
CXCL5 | Homo | 5′AGCTGCGTTGCGTTTGTTTAC3′ | 5′TGGCGAACACTTGCAGATTAC3′ |
TNF | Homo | 5′GAGGCCAAGCCCTGGTATG3′ | 5′CGGGCCGATTGATCTCAGC3′ |
COX2 | Homo | 5′GTCTGATGATGTATGCCACAATCTG3′ | 5′GATGCCAGTGATAGAGGGTGTTAAA3′ |
INOS | Homo | 5′AGGGACAAGCCTACCCCTC3′ | 5′CTCATCTCCCGTCAGTTGGT3′ |
NF-κB | Homo | 5′AACAGAGAGGATTTCGTTTCCG3′ | 5′TTTGACCTGAGGGTAAGACTTCT3′ |
GAPDH | Mus | 5 ‘AGGTCGGTGTGAACGGATTTG3′ | 5′TGTAGACCATGTAGTTGAGGTCA3′ |
YAP | Mus | 5′TGTTGTTGTCTGATCGTTGTGAT 3′ | 5′TGAGATCCCTGATGATGTACCAC 3′ |
JMJD3 | Mus | 5′TGAAGAACGTCAAGTCCATTGTG 3′ | 5′TCCCGCTGTACCTGACAGT3′ |
CXCL1 | Mus | 5′CCACACTCAAGAATGGTCGC | 5′TCTCCGTTACTTGGGGACAC |
CXCL2 | Mus | 5′GAGCTTGAGTGTGACGCCCCCAGG | 5′GTTAGCCTTGCCTTTGTTCAGTATC |
CXCL3 | Mus | 5′CCTACCAAGGGTTGATTTTGAGAC | 5′AGTGGCTATGACTTCTGTCTGGGT |
CXCL5 | Mus | 5′GTTCCATCTCGCCATTCATGC | 5′GCGGCTATGACTGAGGAAGG |