Table 1 Overview of DNA methylation markers in stool evaluated for detection of different stages of colorectal cancer (CRC) and its precursors
Gene | Chromosome | Chen, 2005 [41] | Lenhard, 2005 [23] | Abbaszadegan, 2007 [42] | Itzkowitz, 2008 [39] | Wang, 2008 [43] | Baek, 2009 [44] | Hellebrekers, 2009 [37] | Kim, 2009 [24] | Nagasaka, 2009 [45] | Chang, 2010 [46] | Kalimutho, 2011 [33] | Tang, 2011 [47] | Guo, 2013 [25] | Zhang, 2013 [48] | He, 2014 [26] | Lu, 2014 [49] | Wu, 2014 [36] | Zhang, 2014 [50] | Li, 2015 [27] | Xiao, 2015 [32] | Kriegshäuser, 2017 [38] | Niu, 2017 [51] | Oh, 2017 [35] | Park, 2017 [34] | Yang, 2017 [52] | Han, 2019 [28] | Liu, 2019 [40] | Report frequency | Significant resultsa |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miR-34a | 1 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
ITGA4 | 2 | □↑ | ◊↑ | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
TLX2 | 2 | ∆↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
MLH1 | 3 | □↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
BMP3 | 4 | □↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
SFRP2 | 4 | ◊↑ | ◊↑ | □↑ | ◊↑ | ∆↑ | ∆↑ | ◊↑ | □↑ | 10 | 10 | |||||||||||||||||||
SNCA | 4 | ◊↑ | ◊↑ | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
OSMR | 5 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
TFPI2 | 7 | □↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
GATA4 | 8 | ◊↑ | ∆↑ | 3 | 3 | |||||||||||||||||||||||||
SDC2 | 8 | ◊↑ | ◊↑ | ◊↑ | 3 | 3 | ||||||||||||||||||||||||
CDKN2A | 9 | ◊↑ | □↑ | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
MGMT | 10 | □↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
VIM | 10 | ◊↑ | ◊↑ | □↑ | ∆↑ | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||
miR-34b/c | 11 | ◊↑ | ◊↑ | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
WIF-1 | 12 | ∆↑ | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||
COL4A1 | 13 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
COL4A2 | 13 | ∆↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
ING1 | 13 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
SPART | 13 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
FBN1 | 15 | ◊↑ | ◊↑ | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||
NDRG4 | 16 | ∆↑ | ◊√ | □↑ | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||
HIC1 | 17 | ◊↑ | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||
GATA5 | 20 | ∆↑ | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||
RASSF2 | 20 | ◊↑ | 1 | 1 |