Skip to main content

Table 5 Spearman correlation and covariate-adjusted mediation analysis between top differentially methylated CpG sites and neonatal anthropometry

From: Concentrations of persistent organic pollutants in maternal plasma and epigenome-wide placental DNA methylation

Chemicals ProbeID Gene name Birth weight Birth length Head circumference
Corr. Mediation analysis Corr. Mediation analysis Corr. Mediation analysis
r ACME ADE TE r ACME ADE TE r ACME ADE TE
Σ OCPs cg21733927 SEPT9 0.15*  - 32.96  123.97  91.01 0.21** − 0.08 0.06 − 0.02 0.17** − 0.08 0.33 0.26
cg11938455 DTNBP1 0.23*** − 101.84**** 192.51*** 90.67 0.19** − 0.45**** 0.43 − 0.02 0.18** − 0.18* 0.43* 0.25
cg06510261 GCET2 0.1     0.12     0.15* − 0.15** 0.41* 0.26
cg08704611 HEXDC − 0.16* 24.73* 65.47 90.2 0     − 0.09    
cg00045303 SETD4 − 0.11     0.07     − 0.14 * 0.05 0.21 0.26
cg02303677 TACR2 0.17** 54.32** 37.71 92.02 0.14*  0.16  - 0.19  - 0.03 0.18** 0.06 0.2 0.25
PBDE 47 cg02584377 BCL7A − 0.15* − 17.72*** 17.13 − 0.6 − 0.06     − 0.07    
cg21237837 BMP4 − 0.14* 13.76 − 15.6 − 1.84 − 0.01     − 0.01    
cg18209470 CAV1 − 0.09     − 0.18** − 0.03 0.08 0.05 − 0.09    
cg03621974 CD163 − 0.16* 7.62 − 8.61 − 0.99 − 0.22*** 0.06 − 0.01 0.05 − 0.14* 0.02 0.03 0.05
cg10492999 CLDN9 − 0.15* − 8.07 6.77 − 1.3 − 0.12     − 0.17** − 0.03 0.09 0.06
cg11464615 CRLF1 0.07     0.07     0.15* − 0.03 0.08 0.06
cg25851789 ESRRG 0.09     0.14* − 0.07 0.12 0.05 0.03    
cg13979581 GCC1 − 0.16* 3.94 − 5.2 − 1.26 − 0.07     − 0.06    
cg22306009 GNB2L1 0.14* 2 − 3.02 − 1.02 0.1     0.25*** 0.01 0.05 0.05
cg05089296 GTF2A1 − 0.14* − 9.24 7.75 − 1.49 − 0.15* − 0.06* 0.12 0.06 − 0.1    
cg08308032 HK2 0.11     0.1     0.14* 0 0.05 0.05
cg10123514 HLA-DMB 0.08     0.07     0.15* 0.02 0.04 0.06
cg13524037 HLA-DMB 0.03     − 0.01     0.21** 0.02 0.03 0.05
cg07547765 HOXB7 − 0.15* − 6.67 5.28 − 1.39 − 0.14 * − 0.06** 0.11 0.05 − 0.09    
cg02087289 ICOSLG 0.03     0.05     0.14* 0 0.05 0.05
cg04789362 KIAA0284 − 0.17** − 19.27** 18.38 − 0.89 − 0.16 * − 0.09* 0.14 0.06 − 0.16 * − 0.08** 0.13 0.06
cg01327147 KIAA1161 − 0.11     − 0.08     − 0.15* − 0.07** 0.12 0.05
cg07463167 MAP4K5 − 0.28**** − 21.71*** 19.81 − 1.89 − 0.22** − 0.11*** 0.17 0.06 − 0.03    
cg14827832 METTL16 0.11     0.16* − 0.08* 0.14 0.05 0.22*** − 0.03 0.09 0.06
cg13592399 NID2 − 0.16* 6.64 − 8.13 − 1.49 − 0.13     − 0.12    
cg08405284 OR10H1 0.18 ** 0.1 − 2.31 − 2.21 0.12     0.14    
cg24604417 PARP8 0.12     0.2** − 0.06 0.12 0.06 0.19** − 0.05 0.11 0.05
cg24877391 PEX13 0.04     0.15* − 0.03 0.09 0.06 0.07    
cg24192328 PGF 0.11     0.22*** − 0.03 0.08 0.05 0.14* − 0.02 0.08 0.06
cg02085815 PLK4 0.13     0.17** − 0.01 0.06 0.05 0.07    
cg24715445 RNF126 0.1     0.08     0.16 * 0.04 0.01 0.05
cg25161252 SBK2 0.15* − 2.51 0.71 − 1.8 0.16* − 0.02 0.07 0.05 0.19** − 0.03 0.08 0.05
cg14402591 SEMA6B − 0.16* − 20.81** 19.53 − 1.28 − 0.06     − 0.06    
cg00559054 SSR3 0.08     0.19** − 0.04 0.1 0.06 − 0.02    
cg18601261 STK38L − 0.19** 38.9**** − 40.14 − 1.24 − 0.1     − 0.08    
cg26538590 TK2 − 0.19** 3.36 − 5.22 − 1.87 − 0.13     − 0.11    
cg06869505 TMEM51 − 0.02     0.14* − 0.04 0.09 0.05 − 0.03    
cg17719053 TYW3 − 0.11     − 0.16* − 0.03 0.09 0.06 − 0.06    
cg19530176 ZBTB38 0.09     0.14* − 0.04 0.1 0.06 0.08    
PCB 138_158 cg06219267 FBXO24 − 0.03     0.18** − 0.2* 0.26 0.06 − 0.09    
cg01110147 PSMA3 0.24*** − 0.61 24.39 23.78 0.15* − 0.12* 0.19 0.07 0.18** 0 0.06 0.05
PCB153 cg06219267 FBXO24 − 0.03     0.18** − 0.27* 0.34 0.06 − 0.09    
Σ PCBs cg06219267 FBXO24 − 0.03     0.18** − 0.25** 0.36 0.11 − 0.09    
PFDA cg09441069 FTCD 0.12     0.08     0.22*** − 0.03 − 0.09 − 0.12
cg23851558 LOC400940 0.09     0.17** − 0.04 − 0.18 − 0.21 0.12    
cg18844176 MTHFD1 − 0.03     0.15* − 0.06 − 0.15 − 0.22 − 0.16** 0.04 − 0.16 − 0.12
cg13006259 MYL6B − 0.15* 15.13 − 56.43 − 41.31 − 0.11     0.05    
PFUnDA cg24722365 KIF1B 0.07     0.17** 0.01 − 0.26 − 0.25 0.05    
cg15719126 MAPK8IP1 − 0.22*** 13.35 − 69.97 − 56.62 − 0.18** 0.06 − 0.33 − 0.27 − 0.18** 0.03 − 0.07 − 0.04
cg14067524 MYO16 − 0.15* 0.08 − 58.53 − 58.45 0.03     − 0.04    
cg18145877 TUSC3 − 0.14     − 0.17** − 0.01 − 0.25 − 0.26 − 0.11    
  1. Corr. Spearman correlation, ACME average causal mediation effects, ADE average direct effect, TE total effect
  2. P-values: * < 0.10; **p < 0.05; ***p < 0.01; ****p < 0.001 Adjusted for maternal self-reported race/ethnicity, maternal age in years, fetal sex, maternal pre-pregnancy BMI, cotinine level, total lipids (except PFASs), methylation sample plate, first three methylation principal component (PCs), and the first 10 genotype PCs