Skip to main content

Table 5 Spearman correlation and covariate-adjusted mediation analysis between top differentially methylated CpG sites and neonatal anthropometry

From: Concentrations of persistent organic pollutants in maternal plasma and epigenome-wide placental DNA methylation

Chemicals

ProbeID

Gene name

Birth weight

Birth length

Head circumference

Corr.

Mediation analysis

Corr.

Mediation analysis

Corr.

Mediation analysis

r

ACME

ADE

TE

r

ACME

ADE

TE

r

ACME

ADE

TE

Σ OCPs

cg21733927

SEPT9

0.15*

 - 32.96

 123.97

 91.01

0.21**

− 0.08

0.06

− 0.02

0.17**

− 0.08

0.33

0.26

cg11938455

DTNBP1

0.23***

− 101.84****

192.51***

90.67

0.19**

− 0.45****

0.43

− 0.02

0.18**

− 0.18*

0.43*

0.25

cg06510261

GCET2

0.1

   

0.12

   

0.15*

− 0.15**

0.41*

0.26

cg08704611

HEXDC

− 0.16*

24.73*

65.47

90.2

0

   

− 0.09

   

cg00045303

SETD4

− 0.11

   

0.07

   

− 0.14 *

0.05

0.21

0.26

cg02303677

TACR2

0.17**

54.32**

37.71

92.02

0.14*

 0.16

 - 0.19

 - 0.03

0.18**

0.06

0.2

0.25

PBDE 47

cg02584377

BCL7A

− 0.15*

− 17.72***

17.13

− 0.6

− 0.06

   

− 0.07

   

cg21237837

BMP4

− 0.14*

13.76

− 15.6

− 1.84

− 0.01

   

− 0.01

   

cg18209470

CAV1

− 0.09

   

− 0.18**

− 0.03

0.08

0.05

− 0.09

   

cg03621974

CD163

− 0.16*

7.62

− 8.61

− 0.99

− 0.22***

0.06

− 0.01

0.05

− 0.14*

0.02

0.03

0.05

cg10492999

CLDN9

− 0.15*

− 8.07

6.77

− 1.3

− 0.12

   

− 0.17**

− 0.03

0.09

0.06

cg11464615

CRLF1

0.07

   

0.07

   

0.15*

− 0.03

0.08

0.06

cg25851789

ESRRG

0.09

   

0.14*

− 0.07

0.12

0.05

0.03

   

cg13979581

GCC1

− 0.16*

3.94

− 5.2

− 1.26

− 0.07

   

− 0.06

   

cg22306009

GNB2L1

0.14*

2

− 3.02

− 1.02

0.1

   

0.25***

0.01

0.05

0.05

cg05089296

GTF2A1

− 0.14*

− 9.24

7.75

− 1.49

− 0.15*

− 0.06*

0.12

0.06

− 0.1

   

cg08308032

HK2

0.11

   

0.1

   

0.14*

0

0.05

0.05

cg10123514

HLA-DMB

0.08

   

0.07

   

0.15*

0.02

0.04

0.06

cg13524037

HLA-DMB

0.03

   

− 0.01

   

0.21**

0.02

0.03

0.05

cg07547765

HOXB7

− 0.15*

− 6.67

5.28

− 1.39

− 0.14 *

− 0.06**

0.11

0.05

− 0.09

   

cg02087289

ICOSLG

0.03

   

0.05

   

0.14*

0

0.05

0.05

cg04789362

KIAA0284

− 0.17**

− 19.27**

18.38

− 0.89

− 0.16 *

− 0.09*

0.14

0.06

− 0.16 *

− 0.08**

0.13

0.06

cg01327147

KIAA1161

− 0.11

   

− 0.08

   

− 0.15*

− 0.07**

0.12

0.05

cg07463167

MAP4K5

− 0.28****

− 21.71***

19.81

− 1.89

− 0.22**

− 0.11***

0.17

0.06

− 0.03

   

cg14827832

METTL16

0.11

   

0.16*

− 0.08*

0.14

0.05

0.22***

− 0.03

0.09

0.06

cg13592399

NID2

− 0.16*

6.64

− 8.13

− 1.49

− 0.13

   

− 0.12

   

cg08405284

OR10H1

0.18 **

0.1

− 2.31

− 2.21

0.12

   

0.14

   

cg24604417

PARP8

0.12

   

0.2**

− 0.06

0.12

0.06

0.19**

− 0.05

0.11

0.05

cg24877391

PEX13

0.04

   

0.15*

− 0.03

0.09

0.06

0.07

   

cg24192328

PGF

0.11

   

0.22***

− 0.03

0.08

0.05

0.14*

− 0.02

0.08

0.06

cg02085815

PLK4

0.13

   

0.17**

− 0.01

0.06

0.05

0.07

   

cg24715445

RNF126

0.1

   

0.08

   

0.16 *

0.04

0.01

0.05

cg25161252

SBK2

0.15*

− 2.51

0.71

− 1.8

0.16*

− 0.02

0.07

0.05

0.19**

− 0.03

0.08

0.05

cg14402591

SEMA6B

− 0.16*

− 20.81**

19.53

− 1.28

− 0.06

   

− 0.06

   

cg00559054

SSR3

0.08

   

0.19**

− 0.04

0.1

0.06

− 0.02

   

cg18601261

STK38L

− 0.19**

38.9****

− 40.14

− 1.24

− 0.1

   

− 0.08

   

cg26538590

TK2

− 0.19**

3.36

− 5.22

− 1.87

− 0.13

   

− 0.11

   

cg06869505

TMEM51

− 0.02

   

0.14*

− 0.04

0.09

0.05

− 0.03

   

cg17719053

TYW3

− 0.11

   

− 0.16*

− 0.03

0.09

0.06

− 0.06

   

cg19530176

ZBTB38

0.09

   

0.14*

− 0.04

0.1

0.06

0.08

   

PCB 138_158

cg06219267

FBXO24

− 0.03

   

0.18**

− 0.2*

0.26

0.06

− 0.09

   

cg01110147

PSMA3

0.24***

− 0.61

24.39

23.78

0.15*

− 0.12*

0.19

0.07

0.18**

0

0.06

0.05

PCB153

cg06219267

FBXO24

− 0.03

   

0.18**

− 0.27*

0.34

0.06

− 0.09

   

Σ PCBs

cg06219267

FBXO24

− 0.03

   

0.18**

− 0.25**

0.36

0.11

− 0.09

   

PFDA

cg09441069

FTCD

0.12

   

0.08

   

0.22***

− 0.03

− 0.09

− 0.12

cg23851558

LOC400940

0.09

   

0.17**

− 0.04

− 0.18

− 0.21

0.12

   

cg18844176

MTHFD1

− 0.03

   

0.15*

− 0.06

− 0.15

− 0.22

− 0.16**

0.04

− 0.16

− 0.12

cg13006259

MYL6B

− 0.15*

15.13

− 56.43

− 41.31

− 0.11

   

0.05

   

PFUnDA

cg24722365

KIF1B

0.07

   

0.17**

0.01

− 0.26

− 0.25

0.05

   

cg15719126

MAPK8IP1

− 0.22***

13.35

− 69.97

− 56.62

− 0.18**

0.06

− 0.33

− 0.27

− 0.18**

0.03

− 0.07

− 0.04

cg14067524

MYO16

− 0.15*

0.08

− 58.53

− 58.45

0.03

   

− 0.04

   

cg18145877

TUSC3

− 0.14

   

− 0.17**

− 0.01

− 0.25

− 0.26

− 0.11

   
  1. Corr. Spearman correlation, ACME average causal mediation effects, ADE average direct effect, TE total effect
  2. P-values: * < 0.10; **p < 0.05; ***p < 0.01; ****p < 0.001 Adjusted for maternal self-reported race/ethnicity, maternal age in years, fetal sex, maternal pre-pregnancy BMI, cotinine level, total lipids (except PFASs), methylation sample plate, first three methylation principal component (PCs), and the first 10 genotype PCs