Skip to main content

Table 3 Significant mediating effects of gene methylation on IL-2 outcome

From: DNA methylation mediates the effect of exposure to prenatal maternal stress on cytokine production in children at age 13½ years: Project Ice Storm

Gene

CpG site

DNA methylation

IL-2 outcome

Mediation effect

R 2

Storm32

R 2

DNA methylation

Storm32

Effect (a)

SE

p val.

Effect (b)

SE

p val.

Effect (c')

SE

p val.

Effect (a*b)

Boot SE

Boot LLCI

Boot ULCI

Standardized Effect

DDR1

cg11975790

0.1813

0.0527

0.0201

0.0135

0.1458

0.2919

0.1926

0.1402

0.0209

0.0238

0.3882

0.0154

0.0109

0.0001

0.0449

0.12033

LCK

cg05350315

0.1949

0.0711

0.0260

0.0101

0.1468

0.2279

0.1492

0.1372

0.0201

0.0240

0.4104

0.0162

0.0123

0.0001

0.0504

0.126718

LTA

cg21999229

0.2593

0.1120

0.0340

0.0025

0.1579

0.1881

0.1132

0.1071

0.0152

0.0249

0.5459

0.0211

0.0131

0.0015

0.0559

0.164705

cg14597739

0.2618

0.1198

0.0361

0.0023

0.2009

0.2206

0.1037

0.0418

0.0098

0.0243

0.6884

0.0264

0.0145

0.0061

0.0681

0.206707

cg16219283

0.2575

0.1038

0.0316

0.0026

0.1693

0.2163

0.1208

0.0833

0.0138

0.0247

0.5799

0.0224

0.0142

0.0020

0.0620

0.175555

cg17169196

0.2233

0.0894

0.0299

0.0055

0.1498

0.2020

0.1292

0.1284

0.0182

0.0244

0.4616

0.0181

0.0134

0.0000

0.0566

0.141177

cg02402436

0.2261

0.0932

0.0310

0.0052

0.1701

0.2221

0.1234

0.0818

0.0156

0.0242

0.5244

0.0207

0.0113

0.0038

0.0528

0.161848

cg14441276

0.2038

0.0741

0.0263

0.0084

0.1522

0.2338

0.1467

0.1216

0.0189

0.0241

0.4380

0.0173

0.0119

0.0004

0.0513

0.135532

TGFBR2

cg04916416

0.1641

0.0412

0.0167

0.0193

0.1289

0.3029

0.2346

0.2065

0.0238

0.0238

0.3259

0.0125

0.0090

0.0006

0.0370

0.097494

  1. None of the mediation effects survived Bonferroni correction