Skip to main content

Table 6 Combinations of different methylation markers to create a panel of genes most suited as test in scrapings ranked on highest sensitivity (n = 215)

From: Discovery of new methylation markers to improve screening for cervical intraepithelial neoplasia grade 2/3

Gene combination

Sensitivity CIN2+

Specificity CIN2+

Sensitivity CIN3+

Specificity CIN3+

JAM3/CDH6

80 %

58 %

85 %

48 %

ANKRD18CP/CDH6/EPB41L3

80 %

55 %

87 %

48 %

CDH6/EPB41L3

78 %

57 %

85 %

50 %

GFRA1/EPB41L3/CDH6

78 %

57 %

85 %

50 %

ANKRD18CP/CDH6

77 %

57 %

83 %

49 %

GFRA1/ANKRD18CP/CDH6

77 %

57 %

83 %

49 %

JAM3/EPB41L3/ANKRD18CP

76 %

71 %

84 %

60 %

C13ORF18/JAM3/ANKRD18CP a

74 %

76 %

80 %

62 %

ANKRD18CP/EPB41L3

74 %

74 %

83 %

64 %

GFRA1/EPB41L3/ANKRD18CP

74 %

74 %

84 %

64 %

C13ORF18/CDH6

74 %

58 %

80 %

51 %

JAM3/GFRA1/ANKRD18CP a

73 %

77 %

80 %

64 %

C13ORF18/JAM3/EPB41L3

73 %

72 %

83 %

64 %

GFRA1/CDH6

73 %

60 %

80 %

53 %

JAM3/ANKRD18CP a

72 %

79 %

79 %

65 %

JAM3/EPB41L3

72 %

75 %

83 %

66 %

JAM3/EPB41L3/GFRA1

72 %

76 %

83 %

66 %

GFRA1/EPB41L3

69 %

79 %

82 %

71 %

C13ORF18/EPB41L3

69 %

75 %

81 %

68 %

C13ORF18/JAM3/GFRA1

66 %

82 %

77 %

72 %

JAM3/GFRA1

65 %

86 %

76 %

75 %

C13ORF18/ANKRD18CP

65 %

79 %

72 %

67 %

C13ORF18/JAM3

64 %

88 %

73 %

76 %

GFRA1/ANKRD18CP

64 %

81 %

72 %

69 %

  1. aThese gene combinations showed the highest combined sensitivity and specificity