Skip to main content

Table 5 Lipolysis genes displaying differentially expression accompanied by DMS in obese women compared to controls

From: The epigenetic signature of subcutaneous fat cells is linked to altered expression of genes implicated in lipid metabolism in obese women

 

Expression

DNA methylation

 

Obese

Control

Obese vs control

Adjusted P a

Probes

Region

Obese

Control

Obese vs control

Adjusted P a

 

Av.

SD

Av.

SD

   

Av.

SD

Av.

SD

 

ABHD5

808

64

1327

343

0.61

9.76E−05

cg24595152

Body

0.57

0.06

0.4

0.1

0.17

2.04E−04

ADCY2

24

6

34

8

0.71

1.08E−02

cg07176385

Body

0.69

0.07

0.6

0.05

0.09

9.27E−03

       

cg27629673

Body

0.78

0.07

0.86

0.04

−0.08

8.43E−03

       

cg12378867

3′UTR

0.27

0.1

0.16

0.05

0.11

4.90E−03

ADCY6

302

36

381

53

0.79

3.62E−03

cg22689690

TSS1500

0.04

0.02

0.02

0.01

0.02

1.61E−03

       

cg00160359

5′UTR

0.78

0.06

0.7

0.04

0.08

2.89E−03

       

cg11661914

5′UTR

0.26

0.09

0.14

0.05

0.12

1.33E−03

       

cg24092939

5′UTR

0.18

0.1

0.07

0.03

0.11

8.58E−04

       

cg25196508

5′UTR

0.28

0.13

0.11

0.07

0.17

1.12E−03

       

cg26266429

Body

0.19

0.07

0.1

0.07

0.09

8.53E−04

ADCY7

108

18

63

19

1.72

1.76E−04

cg23580000

1stExon

0.86

0.07

0.93

0.03

−0.07

1.85E−03

       

cg16548911

Body

0.58

0.08

0.68

0.07

−0.1

6.66E−03

ADRB1

57

16

79

23

0.72

2.80E−02

cg13848598

1stExon

0.2

0.07

0.1

0.03

0.1

7.02E−04

       

cg14826456

1stExon

0.08

0.03

0.05

0.02

0.03

1.45E−03

CIDEA

164

44

567

187

0.29

1.01E−06

cg14976646

TSS1500

0.08

0.03

0.05

0.01

0.03

1.34E−03

       

cg19883905

TSS1500

0.05

0.02

0.03

0.01

0.02

4.68E−03

       

cg14923652

3′UTR

0.93

0.03

0.85

0.04

0.08

4.32E−05

CIDEC

1857

174

2597

265

0.71

2.42E−05

cg03604278

TSS1500

0.3

0.09

0.14

0.02

0.16

1.20E−05

       

cg07222243

5′UTR

0.28

0.07

0.13

0.05

0.15

3.13E−05

EDNRA

327

78

463

116

0.71

9.64E−03

cg17073859

TSS1500

0.48

0.05

0.37

0.04

0.11

1.27E−04

       

cg00379467

TSS200

0.23

0.07

0.12

0.04

0.11

5.01E−04

       

cg00974629

TSS200

0.38

0.07

0.25

0.04

0.13

7.57E−05

       

cg05618426

TSS200

0.26

0.09

0.13

0.02

0.13

9.82E−05

EDNRB

618

61

488

81

1.27

3.57E−03

cg07974719

TSS1500

0.31

0.06

0.24

0.03

0.07

9.57E−03

       

cg12983394

TSS1500

0.05

0.04

0.02

0.01

0.03

5.52E−03

       

cg12120741

1stExon

0.29

0.06

0.19

0.04

0.1

3.77E−04

       

cg18210860

Body

0.24

0.12

0.1

0.03

0.14

3.35E−04

GNG7

78

14

112

21

0.69

9.31E−04

cg01286319

5′UTR

0.53

0.1

0.67

0.07

−0.14

1.64E−03

       

cg02309655

5′UTR

0.3

0.08

0.19

0.04

0.11

6.22E−03

       

cg06371583

5′UTR

0.26

0.06

0.19

0.04

0.07

8.78E−03

       

cg08461840

5′UTR

0.54

0.11

0.71

0.09

−0.17

7.26E−04

       

cg11906607

5′UTR

0.33

0.1

0.21

0.07

0.12

3.69E−03

       

cg13078421

5′UTR

0.09

0.05

0.04

0.01

0.05

3.72E−04

       

cg18229071

5′UTR

0.54

0.07

0.64

0.05

−0.1

1.81E−03

       

cg18754118

5′UTR

0.34

0.07

0.25

0.03

0.09

2.71E−03

       

cg19382697

5′UTR

0.77

0.05

0.84

0.03

−0.07

1.03E−03

       

cg19853565

5′UTR

0.15

0.13

0.05

0.02

0.1

1.74E−03

       

cg20091384

5′UTR

0.24

0.07

0.16

0.03

0.08

5.42E−03

       

cg22023664

5′UTR

0.76

0.09

0.88

0.02

−0.12

2.35E−04

       

cg24874003

5′UTR

0.2

0.12

0.07

0.03

0.13

7.32E−04

       

cg27176392

5′UTR

0.92

0.02

0.87

0.03

0.05

1.28E−03

IL6R

141

16

103

13

1.36

1.47E−04

cg24346686

TSS1500

0.13

0.04

0.09

0.03

0.04

7.89E−03

       

cg04437762

Body

0.67

0.07

0.82

0.05

−0.15

1.94E−05

       

cg17001401

Body

0.31

0.08

0.15

0.05

0.16

4.73E−05

       

cg25135018

Body

0.76

0.09

0.88

0.05

−0.12

5.63E−04

INSR

192

19

244

42

0.79

6.85E−03

cg00428638

Body

0.29

0.09

0.16

0.08

0.13

3.34E−03

       

cg09779027

Body

0.33

0.09

0.16

0.05

0.17

3.99E−05

       

cg10148591

Body

0.25

0.08

0.13

0.03

0.12

2.11E−04

       

cg23845936

Body

0.63

0.08

0.43

0.08

0.2

4.44E−05

NPR1

265

41

374

44

0.71

2.21E−04

cg07106989

Body

0.9

0.02

0.81

0.04

0.09

4.62E−05

PDE3B

701

119

972

169

0.72

2.00E−03

cg03439703

TSS1500

0.17

0.04

0.11

0.02

0.06

3.83E−04

       

cg18222865

TSS1500

0.34

0.06

0.2

0.05

0.14

1.10E−04

       

cg21901307

TSS1500

0.1

0.03

0.06

0.01

0.04

1.12E−03

       

cg12177909

Body

0.31

0.1

0.19

0.05

0.12

2.74E−03

PDE5A

118

14

90

17

1.31

3.31E−03

cg15191465

TSS1500

0.05

0.01

0.03

0.01

0.02

2.68E−03

       

cg19191984

TSS1500

0.08

0.02

0.05

0.01

0.03

3.78E−03

       

cg06531595

Body

0.78

0.05

0.71

0.03

0.07

2.47E−03

PLIN2

506

102

408

53

1.24

3.62E−02

cg03885527

Body

0.84

0.04

0.9

0.03

−0.06

4.18E−03

PPARG

1607

142

2096

258

0.77

4.08E−04

cg01412654

TSS1500

0.47

0.08

0.33

0.06

0.14

1.87E−04

       

cg18063278

TSS1500

0.28

0.09

0.15

0.05

0.13

7.36E−04

       

cg25929976

TSS1500

0.24

0.07

0.13

0.04

0.11

1.21E−04

       

cg16197186

5′UTR

0.91

0.03

0.84

0.05

0.07

2.62E−04

       

cg16827534

5′UTR

0.31

0.13

0.15

0.05

0.16

7.11E−04

       

cg10499651

Body

0.23

0.11

0.09

0.02

0.14

8.70E−05

PRKAR2B

1956

324

2467

178

0.79

3.69E−03

cg03661844

Body

0.95

0.03

0.79

0.11

0.16

5.45E−06

       

cg10691109

Body

0.1

0.06

0.04

0.01

0.06

9.79E−05

       

cg26104690

Body

0.77

0.08

0.66

0.07

0.11

3.64E−03

  1. Av average
  2. a Adjusted P comparing groups in Limma (in DNA methylation analysis adjusting for age)