Skip to main content

Table 5 Lipolysis genes displaying differentially expression accompanied by DMS in obese women compared to controls

From: The epigenetic signature of subcutaneous fat cells is linked to altered expression of genes implicated in lipid metabolism in obese women

  Expression DNA methylation
  Obese Control Obese vs control Adjusted P a Probes Region Obese Control Obese vs control Adjusted P a
  Av. SD Av. SD     Av. SD Av. SD  
ABHD5 808 64 1327 343 0.61 9.76E−05 cg24595152 Body 0.57 0.06 0.4 0.1 0.17 2.04E−04
ADCY2 24 6 34 8 0.71 1.08E−02 cg07176385 Body 0.69 0.07 0.6 0.05 0.09 9.27E−03
        cg27629673 Body 0.78 0.07 0.86 0.04 −0.08 8.43E−03
        cg12378867 3′UTR 0.27 0.1 0.16 0.05 0.11 4.90E−03
ADCY6 302 36 381 53 0.79 3.62E−03 cg22689690 TSS1500 0.04 0.02 0.02 0.01 0.02 1.61E−03
        cg00160359 5′UTR 0.78 0.06 0.7 0.04 0.08 2.89E−03
        cg11661914 5′UTR 0.26 0.09 0.14 0.05 0.12 1.33E−03
        cg24092939 5′UTR 0.18 0.1 0.07 0.03 0.11 8.58E−04
        cg25196508 5′UTR 0.28 0.13 0.11 0.07 0.17 1.12E−03
        cg26266429 Body 0.19 0.07 0.1 0.07 0.09 8.53E−04
ADCY7 108 18 63 19 1.72 1.76E−04 cg23580000 1stExon 0.86 0.07 0.93 0.03 −0.07 1.85E−03
        cg16548911 Body 0.58 0.08 0.68 0.07 −0.1 6.66E−03
ADRB1 57 16 79 23 0.72 2.80E−02 cg13848598 1stExon 0.2 0.07 0.1 0.03 0.1 7.02E−04
        cg14826456 1stExon 0.08 0.03 0.05 0.02 0.03 1.45E−03
CIDEA 164 44 567 187 0.29 1.01E−06 cg14976646 TSS1500 0.08 0.03 0.05 0.01 0.03 1.34E−03
        cg19883905 TSS1500 0.05 0.02 0.03 0.01 0.02 4.68E−03
        cg14923652 3′UTR 0.93 0.03 0.85 0.04 0.08 4.32E−05
CIDEC 1857 174 2597 265 0.71 2.42E−05 cg03604278 TSS1500 0.3 0.09 0.14 0.02 0.16 1.20E−05
        cg07222243 5′UTR 0.28 0.07 0.13 0.05 0.15 3.13E−05
EDNRA 327 78 463 116 0.71 9.64E−03 cg17073859 TSS1500 0.48 0.05 0.37 0.04 0.11 1.27E−04
        cg00379467 TSS200 0.23 0.07 0.12 0.04 0.11 5.01E−04
        cg00974629 TSS200 0.38 0.07 0.25 0.04 0.13 7.57E−05
        cg05618426 TSS200 0.26 0.09 0.13 0.02 0.13 9.82E−05
EDNRB 618 61 488 81 1.27 3.57E−03 cg07974719 TSS1500 0.31 0.06 0.24 0.03 0.07 9.57E−03
        cg12983394 TSS1500 0.05 0.04 0.02 0.01 0.03 5.52E−03
        cg12120741 1stExon 0.29 0.06 0.19 0.04 0.1 3.77E−04
        cg18210860 Body 0.24 0.12 0.1 0.03 0.14 3.35E−04
GNG7 78 14 112 21 0.69 9.31E−04 cg01286319 5′UTR 0.53 0.1 0.67 0.07 −0.14 1.64E−03
        cg02309655 5′UTR 0.3 0.08 0.19 0.04 0.11 6.22E−03
        cg06371583 5′UTR 0.26 0.06 0.19 0.04 0.07 8.78E−03
        cg08461840 5′UTR 0.54 0.11 0.71 0.09 −0.17 7.26E−04
        cg11906607 5′UTR 0.33 0.1 0.21 0.07 0.12 3.69E−03
        cg13078421 5′UTR 0.09 0.05 0.04 0.01 0.05 3.72E−04
        cg18229071 5′UTR 0.54 0.07 0.64 0.05 −0.1 1.81E−03
        cg18754118 5′UTR 0.34 0.07 0.25 0.03 0.09 2.71E−03
        cg19382697 5′UTR 0.77 0.05 0.84 0.03 −0.07 1.03E−03
        cg19853565 5′UTR 0.15 0.13 0.05 0.02 0.1 1.74E−03
        cg20091384 5′UTR 0.24 0.07 0.16 0.03 0.08 5.42E−03
        cg22023664 5′UTR 0.76 0.09 0.88 0.02 −0.12 2.35E−04
        cg24874003 5′UTR 0.2 0.12 0.07 0.03 0.13 7.32E−04
        cg27176392 5′UTR 0.92 0.02 0.87 0.03 0.05 1.28E−03
IL6R 141 16 103 13 1.36 1.47E−04 cg24346686 TSS1500 0.13 0.04 0.09 0.03 0.04 7.89E−03
        cg04437762 Body 0.67 0.07 0.82 0.05 −0.15 1.94E−05
        cg17001401 Body 0.31 0.08 0.15 0.05 0.16 4.73E−05
        cg25135018 Body 0.76 0.09 0.88 0.05 −0.12 5.63E−04
INSR 192 19 244 42 0.79 6.85E−03 cg00428638 Body 0.29 0.09 0.16 0.08 0.13 3.34E−03
        cg09779027 Body 0.33 0.09 0.16 0.05 0.17 3.99E−05
        cg10148591 Body 0.25 0.08 0.13 0.03 0.12 2.11E−04
        cg23845936 Body 0.63 0.08 0.43 0.08 0.2 4.44E−05
NPR1 265 41 374 44 0.71 2.21E−04 cg07106989 Body 0.9 0.02 0.81 0.04 0.09 4.62E−05
PDE3B 701 119 972 169 0.72 2.00E−03 cg03439703 TSS1500 0.17 0.04 0.11 0.02 0.06 3.83E−04
        cg18222865 TSS1500 0.34 0.06 0.2 0.05 0.14 1.10E−04
        cg21901307 TSS1500 0.1 0.03 0.06 0.01 0.04 1.12E−03
        cg12177909 Body 0.31 0.1 0.19 0.05 0.12 2.74E−03
PDE5A 118 14 90 17 1.31 3.31E−03 cg15191465 TSS1500 0.05 0.01 0.03 0.01 0.02 2.68E−03
        cg19191984 TSS1500 0.08 0.02 0.05 0.01 0.03 3.78E−03
        cg06531595 Body 0.78 0.05 0.71 0.03 0.07 2.47E−03
PLIN2 506 102 408 53 1.24 3.62E−02 cg03885527 Body 0.84 0.04 0.9 0.03 −0.06 4.18E−03
PPARG 1607 142 2096 258 0.77 4.08E−04 cg01412654 TSS1500 0.47 0.08 0.33 0.06 0.14 1.87E−04
        cg18063278 TSS1500 0.28 0.09 0.15 0.05 0.13 7.36E−04
        cg25929976 TSS1500 0.24 0.07 0.13 0.04 0.11 1.21E−04
        cg16197186 5′UTR 0.91 0.03 0.84 0.05 0.07 2.62E−04
        cg16827534 5′UTR 0.31 0.13 0.15 0.05 0.16 7.11E−04
        cg10499651 Body 0.23 0.11 0.09 0.02 0.14 8.70E−05
PRKAR2B 1956 324 2467 178 0.79 3.69E−03 cg03661844 Body 0.95 0.03 0.79 0.11 0.16 5.45E−06
        cg10691109 Body 0.1 0.06 0.04 0.01 0.06 9.79E−05
        cg26104690 Body 0.77 0.08 0.66 0.07 0.11 3.64E−03
  1. Av average
  2. a Adjusted P comparing groups in Limma (in DNA methylation analysis adjusting for age)