Skip to main content

Table 2 MethPed classification of a set of PNET cases

From: MethPed: a DNA methylation classifier tool for the identification of pediatric brain tumor subtypes

Case ID DIPG Ependymoma ETMR Glioblastoma MB_Gr3 MB_Gr4 MB_SHH MB_WNT Pilocytic astrocytoma
PNET 1 0.02 0.04 0.05 0.85 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03
PNET 2 0.05 0.09 0.14 0.46 0.08 0.08 0.01 0.04 0.04
PNET 3 0.02 0.02 0.01 0.91 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03
PNET 4 0.03 0.07 0.02 0.63 0.02 0.01 0.01 0.02 0.21
PNET 5 0.01 0.03 0.01 0.79 0.03 0.02 0.03 0.01 0.08
PNET 6 0.01 0.01 0.01 0.91 0.01 0.00 0.00 0.00 0.05
PNET 7 0.05 0.19 0.04 0.54 0.03 0.02 0.04 0.02 0.08
PNET 8 0.07 0.50 0.07 0.27 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02
PNET 9 0.04 0.08 0.14 0.40 0.08 0.05 0.01 0.06 0.15
PNET 10 0.04 0.09 0.08 0.49 0.08 0.06 0.03 0.03 0.11
PNET 11 0.04 0.12 0.04 0.47 0.05 0.04 0.02 0.02 0.21
PNET 12 0.06 0.48 0.07 0.27 0.05 0.03 0.01 0.02 0.02
PNET 13 0.05 0.05 0.02 0.68 0.01 0.01 0.00 0.01 0.18
PNET 14 0.06 0.44 0.05 0.36 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03
PNET 15 0.02 0.11 0.05 0.57 0.07 0.03 0.04 0.04 0.08
PNET 16 0.01 0.02 0.03 0.07 0.21 0.04 0.00 0.60 0.03
PNET 17 0.00 0.00 0.00 0.01 0.04 0.94 0.00 0.00 0.00
PNET 18 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.88 0.00 0.01
PNET 19 0.07 0.03 0.03 0.81 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02
PNET 20 0.06 0.04 0.07 0.10 0.08 0.07 0.53 0.02 0.03
PNET 21 0.03 0.04 0.04 0.07 0.63 0.08 0.01 0.07 0.03
PNET 22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.90 0.00 0.01 0.00
PNET 23 0.09 0.09 0.16 0.46 0.07 0.05 0.01 0.02 0.05
PNET 24 0.05 0.31 0.03 0.50 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08
PNET 25 0.11 0.13 0.07 0.58 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03
PNET 26 0.02 0.06 0.02 0.70 0.04 0.02 0.02 0.02 0.11
PNET 27 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.86 0.02 0.01
PNET 28 0.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.96 0.00 0.00